Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMPD4Q9NXE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMPD4Q9NXE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMPD4Q9NXE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMPD4Q9NXE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMPD4Q9NXE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMPD4Q9NXE4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms