Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASF1BQ9NVP2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASF1BQ9NVP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASF1BQ9NVP2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASF1BQ9NVP2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms