Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM100Q9NV29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM100Q9NV29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM100Q9NV29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM100Q9NV29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms