Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF1Q9NS23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF1Q9NS23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF1Q9NS23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF1Q9NS23 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF1Q9NS23 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms