Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS45Q9NRW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS45Q9NRW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS45Q9NRW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS45Q9NRW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS45Q9NRW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms