Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP26Q9NRE1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP26Q9NRE1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP26Q9NRE1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms