Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AKIP1Q9NQ31 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AKIP1Q9NQ31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AKIP1Q9NQ31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIP1Q9NQ31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKIP1Q9NQ31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms