Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MED4Q9NPJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MED4Q9NPJ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MED4Q9NPJ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MED4Q9NPJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MED4Q9NPJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED4Q9NPJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms