Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZDHHC4Q9NPG8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZDHHC4Q9NPG8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZDHHC4Q9NPG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZDHHC4Q9NPG8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZDHHC4Q9NPG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZDHHC4Q9NPG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms