Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDH12Q9NPG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDH12Q9NPG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH12Q9NPG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH12Q9NPG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDH12Q9NPG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH12Q9NPG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms