Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB9BQ9NP90 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB9BQ9NP90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB9BQ9NP90 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB9BQ9NP90 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms