Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D2AQ9NP31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D2AQ9NP31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D2AQ9NP31 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH2D2AQ9NP31 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SH2D2AQ9NP31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms