Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD248Q9HCU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CD248Q9HCU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD248Q9HCU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD248Q9HCU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD248Q9HCU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms