Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM27Q9HBJ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM27Q9HBJ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM27Q9HBJ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM27Q9HBJ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM27Q9HBJ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms