Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00472Q9H8W2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00472Q9H8W2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00472Q9H8W2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00472Q9H8W2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms