Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNCQ9H7C4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNCQ9H7C4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNCQ9H7C4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNCQ9H7C4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNCQ9H7C4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms