Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOX17Q9H6I2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX17Q9H6I2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX17Q9H6I2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX17Q9H6I2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms