Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND2DQ9H6A0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND2DQ9H6A0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DENND2DQ9H6A0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2DQ9H6A0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2DQ9H6A0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DENND2DQ9H6A0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms