Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STN1Q9H668 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
STN1Q9H668 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STN1Q9H668 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STN1Q9H668 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms