Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCX3BQ9H321 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCX3BQ9H321 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCX3BQ9H321 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCX3BQ9H321 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCX3BQ9H321 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCX3BQ9H321 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCX3BQ9H321 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms