Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCXQ9H320 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCXQ9H320 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCXQ9H320 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCXQ9H320 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCXQ9H320 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCXQ9H320 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms