Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R3

TMEM222, Transmembrane protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM222Q9H0R3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM222Q9H0R3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM222Q9H0R3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM222Q9H0R3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM222Q9H0R3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM222Q9H0R3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM222Q9H0R3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM222Q9H0R3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM222Q9H0R3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM222Q9H0R3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM222Q9H0R3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM222Q9H0R3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms