Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC113Q9H0I3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC113Q9H0I3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC113Q9H0I3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC113Q9H0I3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC113Q9H0I3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms