Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
USP44Q9H0E7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
USP44Q9H0E7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP44Q9H0E7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP44Q9H0E7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP44Q9H0E7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP44Q9H0E7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP44Q9H0E7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP44Q9H0E7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP44Q9H0E7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
USP44Q9H0E7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP44Q9H0E7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
USP44Q9H0E7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP44Q9H0E7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms