Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP130Q9H0E3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP130Q9H0E3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAP130Q9H0E3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAP130Q9H0E3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAP130Q9H0E3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms