Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MCOLN1Q9GZU1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MCOLN1Q9GZU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MCOLN1Q9GZU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
MCOLN1Q9GZU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCOLN1Q9GZU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCOLN1Q9GZU1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCOLN1Q9GZU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MCOLN1Q9GZU1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCOLN1Q9GZU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MCOLN1Q9GZU1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
MCOLN1Q9GZU1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
MCOLN1Q9GZU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MCOLN1Q9GZU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MCOLN1Q9GZU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MCOLN1Q9GZU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms