Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTR3CQ9C0K3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTR3CQ9C0K3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTR3CQ9C0K3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms