Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL4Q9C0H6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL4Q9C0H6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL4Q9C0H6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL4Q9C0H6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL4Q9C0H6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms