Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM6Q9C030 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM6Q9C030 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM6Q9C030 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM6Q9C030 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM6Q9C030 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM6Q9C030 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM6Q9C030 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms