Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMCQ9BYG8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMCQ9BYG8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMCQ9BYG8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMCQ9BYG8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMCQ9BYG8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMCQ9BYG8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMCQ9BYG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSDMCQ9BYG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMCQ9BYG8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GSDMCQ9BYG8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms