Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAPPA2Q9BXP8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAPPA2Q9BXP8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAPPA2Q9BXP8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PAPPA2Q9BXP8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PAPPA2Q9BXP8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PAPPA2Q9BXP8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PAPPA2Q9BXP8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PAPPA2Q9BXP8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PAPPA2Q9BXP8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PAPPA2Q9BXP8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PAPPA2Q9BXP8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PAPPA2Q9BXP8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PAPPA2Q9BXP8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms