Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PINK1Q9BXM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PINK1Q9BXM7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PINK1Q9BXM7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PINK1Q9BXM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PINK1Q9BXM7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PINK1Q9BXM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms