Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSBP4Q9BWG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP4Q9BWG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP4Q9BWG4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms