Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD3Q9BV44 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD3Q9BV44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD3Q9BV44 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD3Q9BV44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD3Q9BV44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms