Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf50Q9BV19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf50Q9BV19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf50Q9BV19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf50Q9BV19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf50Q9BV19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms