Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2AFJQ9BTM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFJQ9BTM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFJQ9BTM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms