Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD5Q9BSY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD5Q9BSY4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD5Q9BSY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD5Q9BSY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms