Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG101Q9BSB4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG101Q9BSB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG101Q9BSB4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG101Q9BSB4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG101Q9BSB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms