Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPKQ9BS16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPKQ9BS16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPKQ9BS16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPKQ9BS16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPKQ9BS16 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms