Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNS3Q9BQ31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNS3Q9BQ31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNS3Q9BQ31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNS3Q9BQ31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms