Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CITED1Q99966 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CITED1Q99966 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CITED1Q99966 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CITED1Q99966 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED1Q99966 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CITED1Q99966 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED1Q99966 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CITED1Q99966 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms