Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBBP8Q99708 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBBP8Q99708 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBBP8Q99708 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP8Q99708 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP8Q99708 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBBP8Q99708 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms