Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTRQ99707 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTRQ99707 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTRQ99707 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTRQ99707 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
MTRQ99707 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTRQ99707 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTRQ99707 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTRQ99707 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTRQ99707 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTRQ99707 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTRQ99707 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTRQ99707 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTRQ99707 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTRQ99707 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MTRQ99707 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTRQ99707 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTRQ99707 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTRQ99707 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTRQ99707 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTRQ99707 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTRQ99707 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTRQ99707 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTRQ99707 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTRQ99707 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTRQ99707 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTRQ99707 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTRQ99707 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTRQ99707 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTRQ99707 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTRQ99707 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTRQ99707 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTRQ99707 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTRQ99707 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTRQ99707 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTRQ99707 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTRQ99707 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTRQ99707 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTRQ99707 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTRQ99707 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTRQ99707 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTRQ99707 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTRQ99707 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTRQ99707 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTRQ99707 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTRQ99707 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MTRQ99707 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTRQ99707 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTRQ99707 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTRQ99707 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTRQ99707 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTRQ99707 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTRQ99707 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTRQ99707 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTRQ99707 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTRQ99707 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTRQ99707 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTRQ99707 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTRQ99707 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTRQ99707 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTRQ99707 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTRQ99707 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTRQ99707 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTRQ99707 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTRQ99707 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTRQ99707 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTRQ99707 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTRQ99707 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTRQ99707 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTRQ99707 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTRQ99707 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTRQ99707 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTRQ99707 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTRQ99707 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTRQ99707 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTRQ99707 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MTRQ99707 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTRQ99707 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTRQ99707 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTRQ99707 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTRQ99707 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTRQ99707 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTRQ99707 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTRQ99707 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTRQ99707 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTRQ99707 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTRQ99707 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MTRQ99707 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTRQ99707 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTRQ99707 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTRQ99707 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTRQ99707 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTRQ99707 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTRQ99707 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTRQ99707 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTRQ99707 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTRQ99707 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTRQ99707 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTRQ99707 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTRQ99707 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms