Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN2Q99700 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN2Q99700 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATXN2Q99700 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATXN2Q99700 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN2Q99700 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN2Q99700 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms