Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP88Q99567 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP88Q99567 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP88Q99567 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP88Q99567 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP88Q99567 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP88Q99567 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP88Q99567 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP88Q99567 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP88Q99567 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NUP88Q99567 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP88Q99567 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms