Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT12Q99456 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT12Q99456 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT12Q99456 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT12Q99456 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT12Q99456 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT12Q99456 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT12Q99456 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT12Q99456 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT12Q99456 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT12Q99456 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms