Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNKPQ96T60 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PNKPQ96T60 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNKPQ96T60 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNKPQ96T60 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNKPQ96T60 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNKPQ96T60 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms