Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDRT15Q96T59 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDRT15Q96T59 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDRT15Q96T59 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDRT15Q96T59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDRT15Q96T59 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDRT15Q96T59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms