Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HHIPQ96QV1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HHIPQ96QV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HHIPQ96QV1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HHIPQ96QV1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms