Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3IPQ96QF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB3IPQ96QF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB3IPQ96QF0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IPQ96QF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3IPQ96QF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms